宇宙世纪0079──「一年战争」末期。 地球联邦军以收集MS实战资料为目的的第11独立机械化混编部队， 俗称「天竺鼠队」诞生了。 在头一次面临的战场，邂逅了失控的蓝色MS， 这将引领他们走向「宿命」──！ 1996年发表的杰作游戏「机动战士钢弹外传THE BLUE DESTINY」 藉漫画再度登上舞台！

市之濑达哉是都立阵代高中的一名普通高中生。某一天，一台身份不明的AS突然袭向达哉！这次死定了！——就在他这么想的瞬间，谜之美少女阿德丽娜出现在达哉的面前。 然而少女却身负重伤，达哉只好代替她坐进从未接触过的AS里。而这个决定，竟让他的命运彻底改变…